為有效解決畜禽養殖衍生之有機剩餘資源物處理問題，行政院農業委員會畜產試驗所（簡稱：畜試所）投入有機資源物生物加值整合性科技與應用技術之研發工作，應用前瞻性農業生物黑水虻快速處理有機剩餘資源物，解決剩餘資材體積大、含水量高、容易產生腐敗難聞氣味等問題，產出生物材料黑水虻蟲體，循環投入剩餘資材處理，同時能將幾丁質、幾丁聚醣聚合物和虻糞殘餘物等回收再利用，對土壤物化性質改良、作物保護和飼料添加物具有積極效用，應用畜產剩餘資材，產出可供農業再應用的副產物，以達成資源再生、農畜生產與環境保護三贏的永續經營目標。
黑水虻結合益微生物！提升過往再生循環效率低問題
畜禽有機剩餘資源物再生循環利用方式多以堆肥化處理，產出有機質豐富的堆肥，處理過程中，營養被微生物利用轉化，處理過程費時耗能，產品價值較低。畜試所助理研究員梁世祥指出，為改善有機剩餘資源物處理效能，提升副產品附加價值，利用處理效率較好的資源昆蟲黑水虻，搭配有益微生物群協同處理，生產附加價值較高的幾丁質、幾丁聚醣聚合物，成為植物保護資材，虻糞殘餘物則可做為土壤改良資材應用。
黑水虻極具安全，保護台灣生態環境
黑水虻屬於雙翅目水虻科，完全變態類的腐食性昆蟲，幼蟲取食各種有機資源物，對食物的選擇性較廣，能有效轉換各種有機剩餘資源物，包括各種畜禽有機資源物、餐廚餘、食品加工廠副產物等，吸收並貯存大量的營養與能量，做為蛹發育與成蟲繁殖使用，而成蟲不取食，僅喝少許露水，體形較家蠅大，飛翔緩慢，常被天敵或鳥類捕食。黑水虻不會對人類生活造成干擾，不會對經濟動物造成危害，不會對農作物生產造成影響，是極具生物安全的前瞻性農業生物。
黑水虻改善資源浪費，可望達成農業永續發展宗旨
畜試所所長黃振芳強調，應用資源昆蟲黑水虻，可做為解決畜禽剩餘資源循環利用的前瞻性新方案，能徹底改善畜禽有機剩餘資源物循環效率緩慢與潛在的環境污染，黑水虻產業應用逐步走向技術密集與機械密集的規模產量時代。
在2021年10月農委會也修正可供家畜、家禽和水產動物之飼料，放寬廚餘及歐盟2017/893和2021/1372條例認可的10項動物性產品可做為黑水虻餵養基質，產出的黑水虻乾（粉）經適當加工製程使含水率達13%以下，即可做為家禽和水產動物飼料使用，以植物性飼料餵養所長成之蟲體經加工製成水虻乾（粉），則可做為家畜、家禽和水產動物之飼料。應用可溯源的黑水虻及其副產物，可做不同方面的應用，已成為未來國際農漁牧產業之新趨勢，預期將創造臺灣農漁畜產業新藍海，永續台灣農業發展經營。